Блок циліндрів відлитий із сірого чавуну.
Між циліндрами є канали для охолоджувальної рідини
Циліндри виконані без вставних гільз.
У нижній частині блоку знаходяться п'ять опор корінних підшипників колінчастого валу.
Кришки корінних підшипників виготовлені з ковкого чавуну і кріпляться до блоку двома болтами.
Кришки підшипників розточуються разом із блоком, тому їх не можна міняти місцями.
На всіх кришках, крім кришки третього підшипника, вибиті їхні порядкові номери.
Кришка третього підшипника разом з блоком оброблена по торцях для встановлення напівшайб упорного підшипника.
До торців блоку болтами привернуті кришка ланцюга та сальникоутримувач з манжетами коленвала.
Знизу до блоку кріпиться масляний картер.
Зверху на блоці встановлено головку блоку циліндрів, відлиту з алюмінієвого сплаву. У ній встановлені впускні та випускні клапани.
На кожен циліндр встановлено по чотири клапани, два впускні та два випускні.
Впускні клапани розташовані з правого боку головки, а випускні - з лівої.
Привід клапанів здійснюється двома розподільними валами через гідравлічні штовхачі.
Обслуговування та ремонт двигуна описано у статтях:
Високовольтні дроти та свічки ЗМЗ-406
Гідронатягувач ланцюга ЗМЗ-406
Діагностика системи керування двигуном ЗМЗ-406
Заміна датчика масової витрати повітря ЗМЗ-406
Заміна сальників колінвалу ЗМЗ-406
Мікропроцесорна система запалювання ЗМЗ-406
Особливості системи живлення двигуна ЗМЗ-406
Перевірка компресії двигуна ЗМЗ-406
Перевірка та заміна датчиків ЗМЗ-406
Перевірка та заміна форсунок ЗМЗ-406
Прокладка випускного колектора ЗМЗ-406
Прокладка головки циліндрів ЗМЗ-406
Ремонт головки блоку циліндрів ЗМЗ-405, ЗМЗ-406
Система запалювання з двигуном 406
Система керування двигуном ЗМЗ - 405, 406
Як замінити маслознімні ковпачки ЗМЗ-405, ЗМЗ-406